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2019年6月6日，以李季教授为主的研究院学术委员会给国务院韩正副总理联名递交了一封关于加快我国城乡有机废弃物处理利用的建议书，韩正副总理对此事给予了重要批示，指出：“专家们的建议很好，长三角办公室要认真研究。开展城乡有机废弃物示范工作很有意义，目前我国尚处于初步阶段。长三角地区有条件、有基础、有能力做出示范，要研究透，在关键点上有所突破”。韩正副总理责成国家发改委具体组织落实。示范区建设工作由国家发展改革委员会指导实施，首先在环太湖五市（苏州、无锡、常州、嘉兴、湖州）开展示范区建设，项目涉及环太湖五市269个镇，项目总投资350亿元，目前研究院已向国家发改委提交《环太湖城乡有机废弃物处理利用示范区建设方案》及吴中区区委区政府委托研究院在吴中区三镇（临湖镇、东山镇、金庭镇）开展示范点建设。

作为产业研究院，是中国农业大学在长三角区域重要的科研成果转移转化基地。从2019年开始，研究院率先在苏州吴中临湖镇开展全国首个有机废弃物处理利用示范中心建设工作，现已建成并投入运营3年。2021年3月获批长三角一体化发展专项中央预算内投资项目，7月份与长江生态环保集团长三角分公司签订环太湖地区城乡有机废弃物处理利用项目合作框架协议。目前环太湖有机废弃物处理利用示范区建设已初具成效，苏州市吴中区临湖镇和东山镇处理中心已建设完成，吴江区汾湖项目已成功中标并在筹备建设中，吴中区金庭项目也在推进之中，其余如苏州昆山、常州溧阳、嘉兴海宁、湖北当阳、内蒙巴彦诺尔等项目均在推进中。研究院在积极推动有机废弃物处理示范工程建设的同时，还积极推动有机肥料登记证申请等有机循环产业链相关的其他核心工作，并于2023年成功获批江苏省首张以餐厨废弃物为原料的有机肥料登记证，为餐厨废弃物生产有机肥料和有机肥料的农用提供市场准入保障，为该类型有机肥料替代化肥和实现农田的固碳减排提供产品支持。